البحث السريري والمعرفي يعتمد على فهم دور الجهاز المناعي وعلاقته بالعوامل النفسية والجسدية في تشخيص وعلاج والوقاية من الأمراض. من المعروف أن المناعة لا تعمل بشكل منفصل، بل تتأثر بالهرمونات والناقلات العصبية والحالة النفسية للشخص. وقد دفع ذلك الأطباء والعلماء إلى دمج هذه المعرفة في الممارسة الطبية. واحدة من أهم الاستخدامات هي استخدام الاختبارات المناعية للكشف المبكر عن اضطرابات المناعة وشدة الالتهاب أو فرط النشاط في الجهاز المناعي، مثل أمراض المناعة الذاتية. تستخدم العلامات المناعية أيضا لمراقبة استجابة المرضى للعلاج الدوائي، على سبيل المثال، عند استخدام أدوية مضادة للسرطان. بالإضافة إلى ذلك، تطبق مبادئ المناعة في العلاج النفسي الجسدي، حيث تستخدم تقنيات إدارة التوتر والعلاج السلوكي المعرفي لتعزيز المناعة وفعالية العلاج.